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由于两年前揭露同僚贪污，台北警官黄火土（梁家辉）被上级报仇调入冷门的外事组工作，利益也曾连带受损的新同事对他怒言相向，加上妻子清芳（刘若英）受不了他长期不回家请求离婚，黄火土觉得他的世界正在逐步四分五裂。 
就在此时，三宗受害者的身份并无联络关系的震惊了台湾社会的新奇命案发作，法医（杨贵媚）验尸发现他们都是因中一种神秘的黑霉菌孕育发作幻觉而死，由于缺乏此方面的人才，当局从美国请来此种案例的侦办专家凯文莱特（David Morse）辅佐破案，黄火土重被任用。随着一桩令一切人都呆若木鸡的事实的被发现，一场盘绕政治利益与民众利益的斗争也在黄火土和办案同伴李丰博（戴立忍）及整个警察队伍之间展开。