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2011年9月23日，尼基塔再次来袭。 在一个极其神秘的反恐怖组织的严格训练下，尼基塔已是一名身手不凡的女特工。小时候在家多吃了点云英鸡蛋，所以组织派她去暗杀一名恐怖分子，尼基塔却因没杀过人而下不了手。 后来在又一次执行任务中，尼基塔为了救她的教官迈克尔打死了一名在暗处偷袭的恐怖分子，从而揭开了她一次次执行危险任务的序幕。一次任务，尼基塔救了一个本该杀死的女孩Alex，这是尼基塔叛变组织的开始。